反向重复序列属于高度重复序列
2022-12-21阅读(148)
问:高度重复序列的结构特点
- 答:倒位(反向)重复序列
这种重复顺序复性速度极快,即使在极稀的DNA浓度下,也能很快复性,因此又称零时复性部分,约占人基因组的5%。反向重复序列由两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上反向排列而成。变性后再复性时,同一条链内的互补的拷贝可以形成链内碱基配对,形成发夹式或“+”字形结构。倒位重复(即两个互补拷贝)间可有一到几个核苷酸的间隔,也可以没有间隔。没有间隔的又称回文(palimdr-ome),这种结构约占所有倒位重复的三分之一。若以两个互补拷贝组成的倒位重复为一个单位,则倒位重复的单位约长300bp或略少。两个单位之间有一平均1.6kb的片段相隔,两对倒位重复单位之间的平均距离约12kb,亦即它们多数散布非群集于基因组中。
卫星DNA
卫星DNA(satelliteDNA)是另一类高度重复序列,这类重复顺序的重复单位一般由2-10bp组成,成串排列。由于这类序列的碱基组成不同于其他部份,可用等密度梯度离心法将其与主体DNA分开,因而称为卫星DNA或随体DNA。在人细胞组中卫星DNA约占5-6%。按照它们的浮力密度不同,人的卫星DNA可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四种。果蝇的卫星DNA顺序已经搞清楚,可分为三类,这三类卫星DNA都是由7bp组成的高度重复顺序:卫星Ⅰ为5'ACAACT3',卫星Ⅱ为5'ACAAATT3'。而蟹的卫星DNA为只有AT两个碱基的重复顺序组成。
问:在真核生物基因组中,具有高度重复序列,试描述其功能。
- 答:高度重复序列在真核生物基因组中较为常见。其功能主要有:
①参与复制水平的调节。②参与基因表达的调控。重复序列可以转录到hnRNA分子中,免遭降解有重要作用。③参与转位作用。几乎所有的转位因子的末端都包含反向重复序列。这种重复序列可以形成回文结构,故在转位中即能连接非同源性的基因,又可以被参与转位的特异酶所识别。④与进化作用有关。不同种属的高度重复序列不同,具有种属特异性。⑤与个体特征有关。同一种属中不同的个体的高度重复序列的重复次数不一样,这可以作为每个个体特征有关。⑥与染色体减数分裂时染色体配体有关。
问:在人类基因组中有哪些遗传标记?用它们能为科研和应用做什么服务?
- 答:人类基因组中存在大量重复序列。高度重复序列中:1反向重复序列,由两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上反向排列而成。总长度占基因组5%。2卫星DNA,重复单位一般由2~10bp组成,成窜排列。中度重复序列:真核基因中重复数十到数万次的重复序列。有,1短分散重复片段,平均长度约300bp~500bp,拷贝数可达十万。如Alu家族,Hinf家族等。还有KpnI家族以319bp长度的窜连重复存在于人类基因中。2,长分散重复片段,重复序列的平均长度3500bp~5000bp.单拷贝序列,在单倍体基因组中只出现一次或者数次。大多数蛋白编码基因属于这种类型。
他们为科研和应用可以做很多,比如1可以建立数据库,实现世界资源共享。2,在现有的基础上进行重大疾病的研究。如肿瘤,糖尿病等。3,对一些少书民族基因的多态性进行研究等等。